伝承によれば、天武天皇の勅願寺として673年、井堰山願成就寺無辺光院の名で覚豪阿闍梨により開創され、 奈良時代の天平年間、聖武天皇の勅願寺となり、寺領１千石が加増されたという。 その後、弘仁6年（815年）、 空海によって多宝塔、金堂をはじめとする諸堂が再興されたと伝える。
　「慈眼院」の名は、江戸初期に京都仁和寺の末寺になった際、性承門跡より「慈眼院」の院号が下賜されたことによるという。
　現在の多宝塔は1271年建立で、石山寺、金剛三昧院のものとともに、多宝塔の日本三名塔の一つに数えられる。

（訪問日記）

大阪府内の私の家から近くにありながら、工事中のためなかなか来れなかった寺院である。 数日前に工事が終わったようで、やっと予約をさせていただき、念願の拝観となった。

予想通りというか、参拝客は他におらず、あたり一面に生えた苔が趣のあるこじんまりとした寺院だった。

根来寺大塔や、東寺五重塔のように巨大な仏塔も迫力があって見ごたえがあるが、逆に小さな仏塔の繊細さというか、 品のよさも私は大好きである。

石山寺や金剛三昧院と、この慈眼院多宝塔が日本三名塔に数えられるらしいが、十分うなづける話である。

そんな貴重な仏塔がある割に、マイナーな地位にあまんじている慈眼院だが、今までどおりむやみに人を集めず、いつまでも静かなたたずまいを 保っていてもらいたいものである。